对船舶同步发电机的保护主要有:外短路保护、过电流保护、缺相保护、失压保护等,这些保护都是通过作为发电机主开关的断路器实现的。当检测到这些故障后,信号机构作用在断路器的四连杆机构称为脱扣器上,使断路器跳闸,切断发电机与外部负载的电气连接,从而保护发电机不被损坏。由于发电机组组成的船舶电站还设有分级卸载装置,当过载发生时能自动卸掉次要负载,它其实也是对发电机的过载保护。并联运行时的有功、无功自动分配装置在某种意义上也是避免发电机过载的措施。除此之外,与发电机有关的保护还有绝缘监测装置和自动并车装置等。船舶电力系统是三相对地绝缘系统,当发生某点绝缘低下时绝缘监测装置能自动发出报警,提醒电气人员及时维修,避免其他点再发生绝缘低下而造成短路。自动并车装置在发电机并车时能够自动检测发电机的电压、相位、频率是否满足并联运行条件,避免并车时对发电机的冲击,其实也是对发电机的一种保护。