039型潜艇项目研制时间始于二十世纪80年代中后期,当时中国常规动力潜艇主要为国产化后的6633型(简称033型)与在033型基础上发展而来、自主设计建造的第一代常规动力潜艇035型。这两型潜艇技术根源都来自前苏联633型R级,设计年代早设计思想陈旧,主要性能与80年代西方同期服役的常规动力潜艇差距较大。为了满足海军新时期下的作战要求,并缩小同西方发达国家先进常规潜艇的技术差距,中国正式决定研制新一代常规动力潜艇,并于上世界80年代中后期,正式开始039项目的研制计划。[1]
首艘该型潜艇于2005年竣工。目前已加入中国海军服役。[1]