最初东北海道地区被称“东虾夷地”,1799年时江户幕府采直辖政策,由松前藩支配和并给予阿伊努族自治的权限。1821年起先后改由会津藩(1859年)、熊本藩(1869年)、佐贺藩(1870年)、仙台藩(1871年)负责,直到1871年废藩置县为止。
- 1872年:设置北海道开拓使,并成立根室支厅。
- 1882年02月08日:废除北海道开拓使,根室支厅改为根室县。
- 1886年01月26日:废除根室县,功能转由北海道厅负责。
- 1897年11月:
- 设置根室支厅,下辖原根室国根室郡、花咲郡、野付郡、标津郡、目梨郡和千岛国国后郡、色丹郡、得抚郡、新知郡、占守郡。
- 设置纱那支厅,下辖原千岛国择捉郡、振别郡、纱那郡、蕊取郡。
- 1903年12月:根室支厅与纱那支厅合并。
- 1945年08月:色丹岛及千岛群岛为苏联军队所占领。
- 1952年04月28日:日本放弃包括得抚岛的千岛群岛(得抚郡、新知郡、占守郡)所有权。