由拉玛五世于1888年12月25日作为医疗局创立、王弟丹龙·腊贾努巴亲王任部长。
1905年解散护理部,大部分被转至健康计划部或内政部。
1914年药局成立,提供医护及药物,后更名为健康中心。
1916年内政部更动,并更为公共环境保护署。
1918年医制改革,升格为行政部门。
1926年进行重组,分为13个部门,分别管理。
1942年3月10日再重组。
11月27日为泰国公共卫生纪念日。