编码序列

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编码序列简介

CDS是编码序列(Coding sequence)的缩写。

DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质,所谓CDS就是与蛋白质序列一 一对应的DNA序列,且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列,不考虑mRNA加工等过程中的序列变化,总之,就是与蛋白质的密码子完全对应。

CDS是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语。开放阅读框ORF是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止密码子打断。当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么。

编码序列与开放读码框ORF的区别

(1)开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列;不是所有读码框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。

(2) CDS,是编码一段蛋白产物的序列。

(3)CDS可能是一个ORF,但也可能包括多个ORF。

(4)反之,每个ORF不一定都是CDS。

(5)Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide. Coding sequence (CDS) - The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA ORF-----translation, CDS----transcription translation 是理论上的,而transcription则显然是事实存在的。

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