为严格细胞内寄生、有独特发育周期的革兰氏染色阴性球形微生物。发育周期有原体和始体两个阶段。原体细小,呈圆形,直径0.2~0.4微米,中心有致密的类核结构,它在细胞外极稳定,具高度传染性。始体为较大的圆形颗粒,直径0.8~1.5微米,含核纤维和核蛋白组分,中心无致密的类核结构,始体无传染性,是衣原体在细胞内发育周期的繁殖型,成熟时分裂成大量原体。新形成的原体从受感染细胞内释出,再感染其他细胞。
衣原体寄生于脊椎动物,完成一次发育周期约需40小时,可引起多种疾病。偶而在昆虫中发现,须在鸡胚卵黄囊中培养,对四环素敏感。