1994.07——1998.07,在宁夏大学中文系学习(期间:1996.05当选为第五届自治区学联主席、第六届宁夏青联副主席)。
1998.07——2000.03,宁夏回族自治区政协办公厅秘书处科员。
2000.03——2001.02,宁夏回族自治区政协办公厅秘书处副主任科员。
2001.02——2001.03,宁夏回族自治区政协办公厅秘书处副处级秘书。
2001.03——2004.05,宁夏回族自治区党委宣传部研究室(教育处)副主任(副处长)(2001.09—2001.12自治区党校第40期领导干部进修班培训学习)。
2004.05——2005.01,共青团宁夏回族自治区委统战部副部长(主持工作)。
2005.01——2006.11,共青团宁夏回族自治区委统战部部长(兼任第七届宁夏青联副主席、秘书长,十届全国青联委员)。
2006.11——2007.10,共青团宁夏回族自治区委副书记(正处级)、党组成员(兼任第八届宁夏青联副主席)(期间:2004.09—2007.07中央党校政治学理论专业在职研究生班学习)。
2007.10——2008.06,共青团宁夏回族自治区委副书记、党组成员。
2008.06——2012.06,宁夏回族自治区固原市委常委、市委组织部部长兼市委党校校长。
2012.06——2013.04,固原市委常委、泾源县县委书记。
2013.04——2015.05,共青团宁夏回族自治区党委书记。
2015.05——2018.02,宁夏回族自治区林业厅党组书记、厅长。
2018.02——2021.12,宁夏回族自治区人民政府副秘书长,办公厅主任、党组副书记,自治区政府新闻发言人。[1](2015.09--2018.06东北师范大学行政管理专业研究生学习,获研究生学历、管理学硕士学位)。
2021.12—2022.01 自治区政府党组成员,办公厅党组书记、主任,政府参事室主任。[2]
2022.01,宁夏回族自治区人民政府秘书长、党组成员,办公厅党组书记、主任,政府参事室主任。[2]
政协宁夏回族自治区第九届委员会委员、常委,自治区第十二届委员会委员。
2015年5月20日,宁夏回族自治区第十一届人民代表大会常务委员会第十七次会议通过,决定任命:马金元为自治区林业厅厅长。
2018年2月7日,宁夏回族自治区第十二届人民代表大会常务委员会第一次会议通过,马金元不在担任宁夏回族自治区林业厅党组书记、厅长。[3]
2022年1月17日,宁夏回族自治区十二届人大常委会第三十二次会议,决定任命:马金元为自治区人民政府秘书长。[4]
多年从事政策研究工作,在区内外有关报刊发表理论文章10余篇。
参与编写了宁夏高校“两课”教材等,是《宁夏青少年发展状况蓝皮书(2000年-2005年)》(宁夏人民出版社2006年版)的编写组主任、编委会成员。