1980年09月至1983年07月,在青海省湟源牧校草原专业学习。
1983年07月至1985年08月,青海省玉树县农牧局干部。
1985年08月至1987年09月,玉树县统计局干部。
1987年09月至1990年02月,玉树县计委干部。
1990年02月至1993年07月,玉树县结隆乡副乡长。
1993年07月至1995年04月,玉树县乡镇企业局副局长(期间:1992年08月至1994年07月,青海省委党校大专班经济管理专业学习)。
1995年04月至1996年05月,玉树县东仲经济开发区管委会副主任兼县木材经销公司经理。
1996年05月至1998年07月,玉树县农牧局副局长(正科级)。
1998年07月至1999年05月,玉树县计委主任。
1999年05月至2005年09月,中共玉树县委常委、副县长(期间:2001年08月至2003年12月,中央党校函授学院行政管理专业学习)。
2005年09月至2010年07月,中共囊谦县委书记。
2010年07月至2013年05月,中共玉树州委常委、玉树县委书记。
2013年05月至2013年10月,中共玉树州委副书记、玉树县委书记。
2013年10月至2014年04月,中共玉树州委副书记、玉树市委书记。
2014年04月至2015年02月,中共玉树州委副书记。
2015年02月至2015年07月,中共青海省海北州委副书记、州委统战部部长。
2015年07月至2021年04月,青海省玉树州委书记、常委、委员。
2021年04月至2021年05月,青海省民族宗教事务委员会党组书记。[3]
2021年05月至2023年01月,青海省民族宗教事务委员会党组书记、主任。[4]
2023年01月至今,青海省民族宗教事务委员会党组书记、主任,青海省政协民族和宗教委员会副主任。[1][2]
中共十九大代表,中国共产党青海省第十三届委员会委员,中国人民政治协商会议第十三届青海省委员会委员、常务委员
2015年6月20日,中共青海省委组织部发布青海省委管理干部任前公示,吴德军拟提任为正厅级领导干部。[5]
2017年5月,青海省出席中国共产党第十九次全国代表,吴德军任青海省玉树藏族自治州委书记。
2021年4月,中共青海省委决定:吴德军不再担任中共玉树州委书记、常委、委员职务。[6][7]
2021年5月26日,青海省第十三届人民代表大会常务委员会第二十五次会议通过,任命吴德军为青海省民族宗教事务委员会主任。[4]
2023年1月18日,政协第十三届青海省委员会常务委员会第一次会议通过,吴德军当选中国人民政治协商会议第十三届青海省委员会民族和宗教委员会副主任。[2]
2023年3月18日,青海省第十四届人民代表大会常务委员会第一次会议通过,决定任命:吴德军为青海省民族宗教事务委员会主任。[1]