结构式搜索

结构式搜索

中文名 结构式搜索
特征 化学分子结构图形
意义 结构式图形是化学家的工作语言
分类 搜索方式
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概念

一种以输入化学分子结构图形为特征的化学信息搜索方式,区别于CAS号,化学名称等的数字或文字搜索方法,是化学家在科研或订购化学试剂时最常用的搜索方式。

意义

  1. 在科研中,结构式图形是化学家的工作语言
  2. 子结构搜索能帮助合成化学家找到不同的起始原料,
  3. 药物化学家设计分子时,结构式搜索能够拓展思路。如通过相似结构搜索能激发药物化学家的设计灵感,帮助他们设计出更可行更多变的类似化合物。
  4. 天然产物化学家在寻找类似物时,只要输入母核,一次点击即可马上找到感兴趣的结构。
  5. 分析化学家在寻找标准品时,常常根据具体结构需要而定。

所以,CAS号搜索或化学名称搜索只能给出单一的搜索结果,而结构式搜索既能给出精确搜索结果(精确结构式搜索),也能给出更多的相关搜索(子结构搜索和相似结构搜索)信息,是化学家的必备科研手段之一。

结构式搜索技术

中国开发基于网页的结构式搜索方法有两种:基于smiles的结构式搜索和基于A试剂的结构式搜索。

基于SMILES的结构式搜索

中国掌握的结构式搜索方式多基于SMILES结构分析,试图通过SMILES文字比对的搜索方式,实现结构式搜索。不可否认,这种搜索方式的有一定的用处。比较适合非专业的化工贸易人员。但在不规整或复杂的SMILES匹配过程中,很多化学试剂搜索不到。由于smiles字符串的原因,一些含炔类的化合物均搜索不到结果。

基于Integle的结构式搜索

Integle技术应用分子指纹图谱特征开发的百万级在线结构数据结构式搜索引擎, 其搜索结果准确,比较适合化学家等终端用户。对炔类结构的搜索效果比smiles的方法有很大的改进。

基于smiles的结构式搜索和基于A试剂的结构式搜索适合的用户对像不同,搜索结果的准确程度有所不同。一般来说,基于A试剂的结构式搜索适用范围更广,结果更准确,适合化学家等专业需求较高的使用者。

基于StructureAPI的结构式搜索

Structure API提供了以分子指纹为基础的结构搜索,并提供了更多关于结构搜索的辅助功能,例如:标准产品名转换结构信息,产品结构图自动生成等,其中标准产品名转换结构信息方便了无结构信息的用户提交产品。

除了子结构搜索,相似性搜索,使用Structure API的结构搜索功能可以让用户在不使用画图工具的情况下同样可以进行结构搜索,例如:tert-Butyldimethylsilyl chloride这个产品,同时有同义名如以下:

  1. chloro(1,1-dimethylethyl)dimethyl-silan
  2. chloro-tert-butyldimethyl-silan
  3. Chloro-tert-butyldimethylsilane
  4. Dimethyl-tert-butylchlorosilane

如果用户搜索以上同义名时,而网站中又未记录下这些同义名,Structure API的结构搜索会将这些同义名以结构方式进行匹配,从而搜索到tert-Butyldimethylsilyl chloride,大大提高了客户在您网站中的搜索命中率,从而避免丢失更多的商机。

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