(1)G—C的含量:在一定条件下Tm高低由DNA分子中的G-C含量所决定。G-C含量高时,Tm值比较高,反之则低。这是因为G-C之间的氢键较A-T多,解链时需要较多的能量之故。Tm值和G-C的含量可用二一个经验公式表示:
(G—C)%=(Tm-69.3)×2.44
在一定条件下(pH7.0,0.165MNaCl中)Tm值与(GC)%含量呈正比关系。因此,通过测定Tm值,可以推算出DNA分子中的碱基百分组成。
(2)DNA所处的溶液条件:DNA溶液中离子强度低时,Tm较低,而且熔解温度范围较宽;离子强度较高时,Tm较高,熔解温度范围较窄。因此,在表示某一来源DNA的Tm值时,必须指出其测定条件。
测定原理
双链DNA在热变性时吸光度的增高是温度的函数,以相对吸光度为纵坐标,温度为横坐标作图,查得吸光度增加专时的温度,即为了Tm。
材料和试剂
小牛胸腺DNA,溶于0.1XSSC缓冲液中。
仪器
UV—365型紫外—可见—近红外双光束分光光度计,带有SPR—8程序升温仪。
测定步骤
1.以260nm测定DNA的吸光度,按50ug/ml时A=1.00计算DNA的浓度。
2.关于样品的配制,其总容积为3ml,加入DNA的量为60ug左右;吸光度在0.3—0.4之间,再加10XSSC溶液,使待测液的缓冲液最终浓度为1XSSC。
3.以lXSSC为参比溶液,将参比杯和样品杯加盖密封,并在比色杯的两侧涂以硅油,样品杯放入前槽,参比杯放入后槽,将热电耦插入样品盖的金属管内,然后测定。
4.在25℃测定A260、A280、A230、A260/A280应在1。75—1。85之间,A230/A260应在0.5—0.6之间。
5.按下SPR—8程序升温仪的RUN键,分8步自动控制升温,在75℃后,每升高1℃记录一次吸光度值,一直到94℃吸光度不再变化为止。
数据处理与计算
将记录的温度和相应的吸光度整理成表,将各吸光度乘以相应温度的相对膨胀体积(VT/V25),以校正成相当于25℃水溶液体积的吸光度。用校正后的各吸光度除以25℃的吸光度,得出各个温度的相对吸光度。
用各个温度和相对应的相对吸光度绘制DNA热变性曲线,热变性曲线的中点对应的温度为Tm值。
最后将Tm值代入经验公式求出G-Cmol%:
lXSSC G-C=(Tm一69.3)2.44
0.1XSSC G-C=(Tm一53.9)2.44
经过氯化铯梯度离心而分离纯化的小牛胸腺DNA,其Tm为87℃,G-C含量为42%。