虾夷共和国

1868年4月，江户无血开城, 新的明治政府新撰组的土方岁三也在其中，另有部分法籍官兵，共有军队三千余人。12月25日，士官级以上干部投票，选出榎本为虾夷共和国总裁（总统）。

明治政府外务卿岩仓具视通过外交渠道，要求欧美各国撤回“中立承认”，并随即发兵讨伐。1869年（明治二年）初春爆发箱馆战争，虾夷共和国战败，土方岁三战死。明治二年5月17日（阳历1869年6月26日）榎本决定投降，五棱廓于5月18日转交给政府军陆军参谋黑田清隆，成立一百多天的虾夷共和国结束，同时也代表幕末内战“戊辰战争”的终结。

事后，榎本入狱服刑至明治五年获得特赦。两年后，出任驻俄公使，与沙皇亚历山大二世签订“桦太千岛交换条约”，立下大功。

总裁榎本武扬

副总裁　藤原次仁

海军奉行　荒井郁之助

陆军奉行大鸟圭介

陆军奉行并土方岁三

箱馆奉行　藤原尚志

箱馆奉行并　中岛三郎助

江差奉行　松冈四郎二郎

江差奉行并　小杉雅之进

松前奉行　人见胜太郎

开拓奉行　沢太郎左卫门

会计奉行　榎本道章

会计奉行　川村录四郎

军舰头　甲贺源吾

歩兵头　古屋佐久左卫门

陆海军裁判头取　藤原佐木

陆海军裁判头取　今井信郎