神学主张
他提出基督二性连接说(连接,conjunction,希腊语:sunapheia)。基督二性二位说则是亚历山大学派在会议上对他的基督论所提出的罪名。聂斯脱里认为童贞女玛利亚只是生育耶稣肉体,而非付予神性,因此反对将她神化、礼敬,以「基督之母」(希腊语:Χριστοτόκος)的称呼取代「上帝之母」(也作「生神者」,希腊语:Θεοτόκος)。对於反对称呼马利亚为「生神者」并非聂斯脱里首先提出的论述,而是由一位长老亚他那修所提出,聂斯脱里本著为真理辩护的的热情提文支持此说法。对於聂斯脱里而言,他所要批评的是亚历山大学派过度强调耶稣的神性(拿先素斯的贵格利提出:「基督被动的肉身与神主动的神性融合,人性逐渐消失在神性之中,仿佛水溶在大海里。」)安提阿学派所强调是耶稣真实存在在历史之中,所以耶稣拥有完整的人性即是有理性、感性与自由意识。所以聂斯脱里所反对的是亚历山大学派对于基督两性融合为一新性的说法。但清楚的区分使得亚力山大学派抓住了聂斯脱里认为基督有两个位格的说法。428年,聂里脱里出任君士坦丁堡牧首,引起亚历山大宗主教奚利尔(Cyrillus of Alexandria)猛烈抨击。公元431年,以弗所会议(Ecumenical Council of Ephesus) 召开后,多个派别的冲突虽然被调解,但是聂氏被革除牧首的职务,其教派亦定作异端,最终客死在埃及。
1895年,聂斯脱里晚年的一部著作在叙利亚被发现。在该书中聂里脱里否认以弗所会议的指责,并为自己辩护。聂斯脱里的解释与传统天主教会对他的观点不同,和正统的基督论相近,从而有学者开始怀疑「聂里脱里主义」是否真的是教会传统指控的“不属于三位一体范畴的教义”以及以弗所会议的结论是否客观公正。
1994年11月11日教宗若望保禄二世与东方教会签署了《共同声明》,天主教放弃在第三次大公会议──以弗所会议上对于聂斯脱里的裁定,转而接受其提出对于玛利亚的称呼「基督之母(Mother of God)」或「我们上帝救主基督之母(the Mother of Christ our God and Savior)」
聂斯脱里在东方亚述教会中是被尊为圣徒,“圣聂斯脱里”(Saint Nestorius) 古叙利亚语演变成「玛·聂斯脱里」(Mar Nestorios) 。