阿列克谢二世在苏联吞并爱沙尼亚之后在列宁格勒专心研究神学,1961年升任为主教,1964年成为大主教;1990年苏联解体前夕成为莫斯科大牧首,在位期间,他将分散在全俄各地的东正教教会都统一在莫斯科大牧首的领导之下,并且使俄罗斯东正教回复了苏联时期丧失的道德权威,东正教和罗马天主教的关系也有所好转。不过他在很多问题上引起争议。