弗里德里希·弗朗茨二世是梅克伦堡-什未林大公保罗·弗里德里希与普鲁士公主亚历珊德琳的长子,1823年2月28日生于路德维希斯卢斯特。1842年弗里德里希·弗朗茨19岁时,父亲去世。弗里德里希·弗朗茨继承父位成为梅克伦堡-什未林大公。
即位后的弗里德里希·弗朗茨二世曾周游列国,包括俄罗斯、意大利和东洋国家。1864年的普丹战争中,弗里德里希·弗朗茨二世没有向普鲁士提供一支军队,因为一方面梅克伦堡害怕丹麦对其海岸的威胁,另一方面,丹麦国王是他的好友。普奥战争,他站在普鲁士一方。1871年的普法战争中,弗里德里希·弗朗茨二世是德意志帝国第八军的总指挥,参与了巴黎、奥尔良、勒芒的战役。
弗里德里希·弗朗茨二世于1883年4月15日在什未林去世,终年60岁。长子弗里德里希·弗朗茨三世继位为梅克伦堡-什未林大公。