恩佑寺寺坐西朝东,原有正殿五楹,内奉三世佛像。现仅存山门,门为歇山式无梁结构,黄琉璃瓦顶,石券门,券面上饰有缠枝牡丹纹,门额书“敕建恩佑寺”,是畅春园仅存的两座建筑之一。
1981年恩佑寺山门被海淀区政府公布为海淀区重点文物保护单位。
1985年北京市文物局重修。