明代种有曲阜衍圣公府的祀田,初名“小屯”,后改今名,习称“屯里”。自樊姓迁来后,成望族,村名曾一度称樊家屯。清代咸丰二年,土绅为抵御捻军的侵袭,修筑了土围墙,建有四座寨门,门额镌“长庆寨”三字。故名长庆屯。