2010 年 12 月 7 日,由于菲律宾宪法规定,在菲律宾注册的企业的股权不可 100% 为外国机构所有,因此马来西亚籍投资者 Tony Fernandes 和部分菲律宾商人协商以 40 比 60 的方式合资成立菲律宾亚航,该项投资通过菲律宾投资局的批准。
2011 年 8 月 5 日,菲律宾亚航的第一架全新空中客车A320客机,抵达克拉克自由港区的克拉克国际机场。同年 11 月 8 日,接收第二架 A320 客机。
2012 年 2 月 7 日,菲律宾亚航取得来自菲律宾民航局批准的飞航证书,有权在菲律宾领空进行飞航作业。
2012 年 4 月 8 日,菲律宾亚航与菲律宾最大的巴士公司 Victory Liner 合作,为克拉克国际机场的旅客提供免费的接驳服务。
菲律宾亚洲航空的国内线有克拉克(枢纽)、达沃、卡利博、宿务等。
菲律宾亚洲航空的国际线有马来西亚吉隆坡、亚庇,香港,新加坡(2012 年 12 月 15 日开航),台湾台北等。(2012 年 12 月 16 日开航)