1952年秋大韩民国陆军士官学校考试合格入校
1953年陆军士官学校(13期)毕业
1961年首尔国立大学哲学科
1964年行政大学院委托教育
1964〜1969年,任陆军士官学校教授部専任讲师·助教授
1973〜1976年,历任野战军师团作战参谋、合同参谋本部战略企划课长
1976〜1977年,歩兵连队长
1977年〜1980年,陆军本部战略企划处长(陆军准将)
1980年10月晋升陆军少将
1981年3月2日担任韩国驻尼日利亚大使,负责1982年8月19日至22日前总统全斗焕访问尼日利亚的任务。
1984年〜1987年任驻奥地利大使。
1988年〜1992年,任外交安保研究院院长。
1990年负责军备控制企划团团长。
1990年举行南北高官会谈,任代表一职。
1992年被任命为统一部次官,当年9月南北高层会谈中,国家安全企划部发生李东馥哲特别助理的《总统训令造假事件》而被替换。
1992年任南北交流合作分科委员会委员长一职。
1993年以后,任中央民族统一协议会议长、统一政策评价委员
1994年以军队出身担任韩国世宗研究所客座研究员
1995年1月支持《阳光政策研究》而被任命为亚太和平财团事务总长。
1998年2月25日金大中当选总统后,任命为总统秘书室外交安保首席秘书官(次官级)。
1998年兼任国家安全保障会议事务处长。
1999年5月任第2代大韩民国统一部长官
1999年12月-2001年3月任大韩民国国家情报院院长
2002年6月29日爆发第二次延坪海战,林东源发表对朝鲜友好的发言,他在安保会议上表示:“此次事件是偶发性的发言”,金正日并没有介入,因此对北支援和金刚山事业也应该继续。对此,叛逃的前朝鲜劳动党高官黄长烨表示:“在朝鲜军部没有金正日批准的命令,是不可能发射大浦洞导弹的”、“朝鲜军方内部的强硬势力的突发行动的故事”,对林东源的发言进行了反驳。
2005年11月14日,首尔中央地方检察厅以违反《通信秘密保护法》等嫌疑申请了对前国情院院长林东源和辛建哲的拘捕令。检察机关表示:“国情院利用窃听非法监听国内政治。”并称:“能够改变国情院长的人只有一个人,但他们反而追加投入许多预算,进行非法监听装备开发,收集非法监听资料”。