联邦教育及研究部的前身是1955年成立的联邦原子部,负责研究核能源的和平使用。1962年改名为联邦科学研究部。1969年再改名为联邦教育及科学部,直到1994年与联邦研究及科技部合并后才改为联邦教育及研究部。