复杂系统、文化系统工程(精神文明、文化建设、文化发展)、社会系统工程、卓越治理(Governance Excellence)、民商法、人体科学、东方哲学/宗教等领域的研究/建模/设计/立法/开发/测评/顾问/策划/教育工作.
20世纪90年代初参与“中国律师管理信息系统工程(LMIS)”、“全国律师资格考试成绩统计分析与录取决策支持系统工程(SASMLE)”等项目.
1994-1995年受中共海南省文昌县委书记朱明国(现任中共中央纪律检查委员会委员,中共广东省委常委、省纪律检查委员会书记,中共17大代表)邀请,作为社会系统工程专家组成员参与中国首起社会系统工程实践推广活动,取得显著效益, (https://60.10.6.113/sseweb/ShowArticle.asp?ArticleID=525),(http: //60.10.6.113/sseweb/ShowArticle.asp?ArticleID=522),(http://60.10.6.113 /sseweb/ShowArticle.asp?ArticleID=521),(http://60.10.6.113/sseweb /ShowArticle.asp?ArticleID=517),(http://60.10.6.113/sseweb /ShowArticle.asp?ArticleID=518),(http://60.10.6.113/sseweb /ShowArticle.asp?ArticleID=514).
2002-2003年参与教育部“新世纪网络课程建设工程项目”(面向21世纪课程教材)“刑事诉讼法学网络课程”.
2002年07月~2008年03月,作为社会系统工程专家组成员受中共陕西省榆林市委书记周一波(现任陕西省政协副主席,中共陕西省委统战部部长,中共17大代表,政协第11届全国委员会委员)邀请,从事陕西省榆林市跨越发展社会系统工程研究(后更名为“陕西省榆林市‘推动科学发展、促进社会和谐’社会系统工程”项目,列入陕西省榆林市重大科技计划项目), (http://60.10.6.113/sseweb/ShowArticle.asp?ArticleID=1939)侧重与文化系统工程与文化发展方面(http://60.10.6.113/sseweb/ShowArticle.asp?ArticleID=2103),并参与指导米脂县档案系统工程研究(http://60.10.6.113/sseweb/ShowArticle.asp?ArticleID=1906).
2002-2003年参与教育部“新世纪网络课程建设工程项目”(面向21世纪课程教材)“刑事诉讼法学网络课程”(http://202.116.65.197/susong/).
2005-2006年参与“《广东省预防未成年人犯罪条例(草案)》立法系统工程”项目.
2006~2007年主持广东省人民检察院“行政违法行为的检察监督”项目.
◆ 《民法典立法的系统工程应用》(2002).
◆ 《综合集成——民法典立法的科学思想》[马新学(马深),载陈光亚主编:《Well-off Society Strategies and Systems Engineering--Proceedings of the 13th Annual Conference of System Engineering Society of China》(中国系统工程学会第13届年会论文集),Global-Link Publisher, 2004年10月,第346~351页].
◆ 《论建立国家赔偿制度的立法目的及法律意义》(1988).
◆ 《关于政治体制改革的若干思考》(2002).
◆ 《法源》(1996).
◆ 《法治的理想化思考》(1997).
◆ 《人才发展的多元化趋势与构筑多样化文化环境》(1995).
◆ 《“为民作主”观念之法律剖析》(1995).
◆ 《从原始社会人类遗传和语言产生的假设中看权与法特征》(1996,荣获“中国法治现代化道路国际学术研讨会”2等奖).
◆ 《清官情节与现代法治》(2002).
◆ 《儿童教育中的民法原理》(1995).
◆ 《法庭活动中的舆论监督》(1995).
◆ 《冥想——解放灵感的自由女神》(1988).
◆ 《人体潜能与未来社会》(1989).
◆ 《中西方监狱管理个案分析与系统工程应用》[马新学(马深),兰州:《甘肃政法学院学报》,1996年第1期,第58~63页].
◆ 《中华法学大辞典•民法卷》(部分辞条,1998).
◆ 《民法债权》(参编,2002).
◆ 《民法总论》(副主编,2002).
◆ 《“科学发展观”与“和谐社会”的系统语义——当代中国领导层系统思维的科学解读》,“中国领导层系统思维国际研究计划”研究报告,(https://60.10.6.113/sseweb/ShowArticle.asp?ArticleID=578).