本草基因组学

本草基因组学作为中草药研究的热点领域，在中药现代化发展中发挥着重要作用。《本草基因组学》作者长期工作在本草基因组学研究一线，结合各自研究工作介绍了本草基因组学的主要研究内容及其应用。《本草基因组学》**章至第八章为基础篇，包括概述、结构基因组学、转录组学、功能基因组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学和宏基因组学等；第九章至第十五章为应用篇，包括药用模式生物、中药合成生物学、基因组辅助育种、 DNA鉴定、中药体内代谢基因组研究、关键实验技术和生物信息学及数据库等。^[1]

**章概述3

**节本草基因组学的产生和发展3

第二节本草基因组学研究内容8

第三节本草基因组学的实践应用12

参考文献14

第二章结构基因组学17

**节中草药核基因组研究18

第二节中草药叶绿体基因组研究40

第三节中草药线粒体基因组研究51

参考文献64

第三章转录组学67

**节根及根茎类中草药转录组69

第二节皮类中草药转录组78

第三节叶及花果类中草药转录组82

第四节全草类中草药转录组86

第五节真菌类中草药转录组91

参考文献95

第四章功能基因组学——天然产物生物合成途径解析100

**节天然产物生物合成途径解析策略101

第二节萜类生物合成途径解析104

第三节生物碱类合成途径解析110

第四节黄酮类生物合成途径解析116

参考文献118

第五章蛋白质组学123

**节中草药蛋白质组研究124

第二节中药作用靶点的蛋白质组研究128

参考文献132

第六章代谢组学135

**节代谢组学研究方法136

第二节中草药鉴别和质量控制的代谢组学研究139

第三节中草药有效成分合成的代谢组学研究144

第四节中草药抗逆代谢组学研究147

参考文献148

第七章表观基因组学151

**节中草药非编码RNA152

第二节中草药DNA甲基化与RNA编辑157

参考文献162

第八章宏基因组学165

**节宏基因组学研究策略与应用前景166

第二节中草药土壤宏基因组168

第三节中草药内生菌宏基因组177

参考文献179

第九章药用模式生物研究185

**节药用模式生物研究概述186

第二节药用模式真菌——灵芝191

第三节药用模式植物——丹参196

第四节其他相关模式生物202

参考文献204

第十章中药合成生物学研究208

**节中药合成生物学体系优化策略208

第二节萜类合成生物学研究213

第三节生物碱合成生物学研究217

第四节黄酮合成生物学研究221

参考文献223

第十一章基因组辅助育种研究229

**节基因组辅助优质高产中草药的选育230

第二节基因组辅助中草药抗逆育种234

参考文献237

第十二章DNA鉴定研究239

**节中药DNA条形码鉴定241

第二节叶绿体全基因组超级条形码257

第三节基于分子杂交等技术的中药鉴定261

参考文献268

第十三章中药体内代谢基因组研究270

**节中药基因组研究272

第二节肠道宏基因组研究275

参考文献278

第十四章关键实验技术281

**节中草药基因组关键技术283

第二节中药基因功能研究关键技术290

第三节蛋白质组学关键技术295

第四节代谢组学关键技术298

第五节合成生物学关键技术300

参考文献303

第十五章生物信息学及数据库305

**节生物信息学分析方法306

第二节基因组相关数据库309

参考文献313

索引315^[1]