反向重复序列 (inverted repeat sequence):
如图一GTGCTAA和TTAGCAC构成反向重复序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。(图一上面的序列为反向重复序列,同时,注意到它两条链顺读是一样的,且中间没有间隔序列,因此它是回文序列;图一下面的序列为镜像重复序列。详情参见下文辨析。)
回文结构(palindromic structure):
在真核细胞染色质DNA分子中,还存在大量特殊的序列,这种结构中脱氧核苷酸的排列在DNA两条链中顺读与倒读其意义是一样的,脱氧核苷酸的排列
对于一个假象的轴成180°旋转对称,这种结构称为回文结构。
几种重复序列辨析(非正式名词解释):
反向重复序列(Inverted repeat sequence) | 5'AAAANNNNTTTT3'3'TTTTNNNNAAAA5' | 两条链中以5'->3'方向读出来是一样的,两条链旋转对称。 |
回文序列(Palindromic sequence) | 5'AAAATTTT3'3'TTTTAAAA5' | 当反向重复序列中没有“NNNN”时就称为回文序列,两条链旋转对称。 |
正向重读序列(Direct repeats sequence) | 5'ATCGNNNNATCG3'3'TAGCNNNNTAGC5' | 在同一条序列中有重复(NNNN的前后序列都是AAAA),中间的NNNN可有可无。 |
镜像重复序列(Mirror repeats) | 5'ATCGNNNNGCTA3'3'TAGCNNNNCGAT5' | 两条链都呈轴对称。 |