转移酶是以“(供体)(受体)(官能团)转移酶”的格式来命名。但是,亦有一些其他格式而普遍的名称:“(受体)(官能团)转移酶”或“(供体)(官能团)转移酶”,例如DNA甲基转移酶就是一种能催化甲基转移至脱氧核糖核酸(DNA)受体的转移酶。
转移酶在EC编号中分类为EC2,并再细分为9个子类:
EC2.1包括转移一个碳分子团的酶
EC2.2包括转移醛或酮的酶
EC2.3包括酰基转移酶
EC2.4包括糖基转移酶
EC2.5包括转移烷基或芳基的酶,但不包括转移甲基。
EC2.6包括转移含氮团的酶
EC2.7包括转移含磷团的酶
EC2.8包括转移含硫团的酶
EC2.9包括转移含硒团的酶
EC编号
氧化还原酶
水解酶
裂合酶
异构酶
连接酶